Приказ о его назначении подписал министр науки и высшего образования России. Ранее Александр Вагнер занимал должность исполняющего обязанности вуза.
Александр Вагнер родился в 1983 году в селе Усть-Бакчар Томской области. В 2006 году окончил физико-технический факультет Томского политехнического университета по специальности «Физика атомного ядра и элементарных частиц».
В 2009 году окончил аспирантуру Томского политеха по специальности «Приборы и методы экспериментальной физики» и защитил кандидатскую диссертацию на тему «Монохроматизация пучков рентгеновского излучения электронных ускорителей». В этом же году ему была присуждена ученая степень кандидата физико-математических наук.
Работал в Томском политехническом университете с марта 2006 года. Занимал должности инженера, инженера-проектировщика, старшего преподавателя, доцента и заведующего кафедрой прикладной физики физико-технического факультета, работал начальником научного отдела физико-технического института, заместителем директора по развитию Исследовательской школы физики высокоэнергетических процессов. В 2017 – 2019 годах занимал должность проректора по образовательной деятельности Томского политехнического университета.
В 2020 году был назначен проректором Дальневосточного федерального университета (ДВФУ).